Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15,38■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15,37■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,36■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,35■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,34■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15,33■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,05
Pglyrp4Q0VB07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,33■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15,33■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15,33■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,33■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15,33■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15,32■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,32■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,32■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15,32■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,31■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,3■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,3■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15,3■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15,3■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,3■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,3■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,3■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,28■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15,28■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15,28■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,28■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,28■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,28■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,28■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,27■□□□□ 0,04
Pglyrp4Q0VB07 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,27■□□□□ 0,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,3 ms