Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncf1Q09014 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncf1Q09014 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncf1Q09014 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ncf1Q09014 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncf1Q09014 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.5 ms