Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cass4Q08EC4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cass4Q08EC4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms