Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgm3Q08189 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgm3Q08189 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgm3Q08189 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgm3Q08189 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms