Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox4Q06831 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox4Q06831 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox4Q06831 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms