Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdr16c6Q05A13 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdr16c6Q05A13 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdr16c6Q05A13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms