Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sox13Q04891 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox13Q04891 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox13Q04891 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms