Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emx2Q04744 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emx2Q04744 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emx2Q04744 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emx2Q04744 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emx2Q04744 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emx2Q04744 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emx2Q04744 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emx2Q04744 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emx2Q04744 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Emx2Q04744 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms