Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk16Q04735 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk16Q04735 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk16Q04735 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdk16Q04735 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk16Q04735 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk16Q04735 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk16Q04735 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk16Q04735 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk16Q04735 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms