Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcad1Q04692 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcad1Q04692 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcad1Q04692 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms