Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cxcr5Q04683 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cxcr5Q04683 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms