Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpd1Q04519 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd1Q04519 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpd1Q04519 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms