Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RelaQ04207 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RelaQ04207 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RelaQ04207 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RelaQ04207 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RelaQ04207 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RelaQ04207 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RelaQ04207 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RelaQ04207 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RelaQ04207 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RelaQ04207 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RelaQ04207 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms