Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scg2Q03517 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scg2Q03517 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scg2Q03517 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scg2Q03517 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms