Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RykQ01887 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RykQ01887 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RykQ01887 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RykQ01887 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
RykQ01887 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RykQ01887 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RykQ01887 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RykQ01887 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RykQ01887 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RykQ01887 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RykQ01887 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RykQ01887 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RykQ01887 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RykQ01887 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RykQ01887 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RykQ01887 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RykQ01887 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RykQ01887 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RykQ01887 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RykQ01887 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RykQ01887 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RykQ01887 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RykQ01887 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RykQ01887 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RykQ01887 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RykQ01887 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RykQ01887 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RykQ01887 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RykQ01887 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RykQ01887 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RykQ01887 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RykQ01887 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RykQ01887 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RykQ01887 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RykQ01887 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RykQ01887 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RykQ01887 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RykQ01887 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RykQ01887 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RykQ01887 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RykQ01887 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RykQ01887 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RykQ01887 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RykQ01887 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RykQ01887 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RykQ01887 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RykQ01887 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RykQ01887 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RykQ01887 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RykQ01887 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RykQ01887 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RykQ01887 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RykQ01887 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RykQ01887 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RykQ01887 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RykQ01887 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RykQ01887 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RykQ01887 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RykQ01887 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RykQ01887 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RykQ01887 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RykQ01887 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RykQ01887 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RykQ01887 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RykQ01887 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RykQ01887 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RykQ01887 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RykQ01887 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RykQ01887 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RykQ01887 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RykQ01887 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RykQ01887 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RykQ01887 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RykQ01887 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RykQ01887 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RykQ01887 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RykQ01887 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RykQ01887 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RykQ01887 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RykQ01887 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms