Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme2Q01768 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme2Q01768 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nme2Q01768 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms