Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gjb2Q00977 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gjb2Q00977 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gjb2Q00977 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms