Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pax8Q00288 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pax8Q00288 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pax8Q00288 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax8Q00288 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms