Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PrkdcP97313 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkdcP97313 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkdcP97313 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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