Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mesp1P97309 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mesp1P97309 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mesp1P97309 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mesp1P97309 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms