Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43bP86448 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim43bP86448 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim43bP86448 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim43bP86448 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim43bP86448 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms