Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vgll3P85442 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vgll3P85442 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vgll3P85442 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms