Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nucb2P81117 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nucb2P81117 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nucb2P81117 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb2P81117 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb2P81117 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms