Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx1P81068 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx1P81068 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx1P81068 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx1P81068 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx1P81068 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx1P81068 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx1P81068 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx1P81068 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx1P81068 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx1P81068 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx1P81068 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms