Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctps1P70698 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctps1P70698 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctps1P70698 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctps1P70698 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms