Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad50P70388 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad50P70388 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rad50P70388 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad50P70388 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad50P70388 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rad50P70388 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad50P70388 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad50P70388 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad50P70388 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad50P70388 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad50P70388 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad50P70388 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms