Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbx6P70327 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbx6P70327 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx6P70327 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbx6P70327 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbx6P70327 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx6P70327 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx6P70327 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx6P70327 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx6P70327 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx6P70327 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tbx6P70327 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbx6P70327 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbx6P70327 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbx6P70327 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbx6P70327 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tbx6P70327 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbx6P70327 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx6P70327 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx6P70327 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx6P70327 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx6P70327 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx6P70327 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbx6P70327 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbx6P70327 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbx6P70327 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbx6P70327 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tbx6P70327 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tbx6P70327 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tbx6P70327 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tbx6P70327 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms