Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbx1P70323 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tbx1P70323 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tbx1P70323 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tbx1P70323 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms