Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54lP70270 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad54lP70270 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54lP70270 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms