Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SbdsP70122 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SbdsP70122 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SbdsP70122 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SbdsP70122 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SbdsP70122 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SbdsP70122 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SbdsP70122 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SbdsP70122 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SbdsP70122 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SbdsP70122 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SbdsP70122 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SbdsP70122 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SbdsP70122 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms