Protein–RNA interactions for Protein: P63330

Ppp2ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2caP63330 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp2caP63330 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp2caP63330 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp2caP63330 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp2caP63330 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms