Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpnP63163 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpnP63163 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SnrpnP63163 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpnP63163 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpnP63163 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpnP63163 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpnP63163 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpnP63163 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpnP63163 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpnP63163 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpnP63163 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpnP63163 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SnrpnP63163 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SnrpnP63163 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SnrpnP63163 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms