Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl8P62918 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl8P62918 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl8P62918 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms