Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2bP62915 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2bP62915 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2bP62915 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2bP62915 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf2bP62915 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf2bP62915 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtf2bP62915 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms