Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl39P62892 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl39P62892 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms