Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,59□□□□□ -0,23
Rps28P62858 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,58□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,58□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13,58□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13,58□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,58□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,57□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,56□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,56□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,56□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,56□□□□□ -0,24
Rps28P62858 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13,56□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13,56□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13,56□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,55□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13,55□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13,55□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,55□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,55□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,55□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13,55□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13,54□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,53□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,52□□□□□ -0,24
Rps28P62858 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,52□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13,52□□□□□ -0,24
Rps28P62858 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13,52□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,52□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13,52□□□□□ -0,24
Rps28P62858 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13,52□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13,52□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13,52□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,52□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,52□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,51□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13,5□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,5□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,5□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,5□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13,5□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,5□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13,5□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13,49□□□□□ -0,25
Rps28P62858 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13,49□□□□□ -0,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,8 ms