Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab3cP62823 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3cP62823 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3cP62823 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3cP62823 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms