Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vsnl1P62761 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vsnl1P62761 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vsnl1P62761 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vsnl1P62761 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms