Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm5P62322 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm5P62322 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm5P62322 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm5P62322 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm5P62322 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm5P62322 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm5P62322 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm5P62322 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm5P62322 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms