Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpd1P62315 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpd1P62315 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpd1P62315 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrpd1P62315 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrpd1P62315 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrpd1P62315 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrpd1P62315 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpd1P62315 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpd1P62315 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpd1P62315 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms