Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme3P61290 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme3P61290 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme3P61290 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme3P61290 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme3P61290 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme3P61290 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme3P61290 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme3P61290 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psme3P61290 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme3P61290 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psme3P61290 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme3P61290 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme3P61290 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psme3P61290 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme3P61290 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme3P61290 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme3P61290 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme3P61290 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psme3P61290 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme3P61290 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme3P61290 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psme3P61290 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms