Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d1P61080 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d1P61080 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2d1P61080 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms