Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2d3P61079 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2d3P61079 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2d3P61079 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2d3P61079 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms