Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdrg1P59048 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdrg1P59048 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdrg1P59048 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdrg1P59048 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms