Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpm1P58771 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpm1P58771 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm1P58771 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms