Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp1P58466 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctdsp1P58466 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctdsp1P58466 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms