Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmoP56726 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmoP56726 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmoP56726 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SmoP56726 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SmoP56726 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmoP56726 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmoP56726 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SmoP56726 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SmoP56726 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SmoP56726 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmoP56726 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmoP56726 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmoP56726 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmoP56726 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SmoP56726 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SmoP56726 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SmoP56726 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmoP56726 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmoP56726 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SmoP56726 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SmoP56726 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmoP56726 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmoP56726 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmoP56726 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SmoP56726 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmoP56726 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmoP56726 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmoP56726 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmoP56726 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SmoP56726 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmoP56726 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmoP56726 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmoP56726 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SmoP56726 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SmoP56726 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmoP56726 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SmoP56726 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmoP56726 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmoP56726 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SmoP56726 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmoP56726 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmoP56726 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SmoP56726 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmoP56726 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmoP56726 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmoP56726 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SmoP56726 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmoP56726 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmoP56726 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SmoP56726 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmoP56726 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmoP56726 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmoP56726 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SmoP56726 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmoP56726 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SmoP56726 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmoP56726 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmoP56726 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SmoP56726 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmoP56726 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmoP56726 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmoP56726 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SmoP56726 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SmoP56726 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SmoP56726 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SmoP56726 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SmoP56726 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SmoP56726 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SmoP56726 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SmoP56726 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SmoP56726 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SmoP56726 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SmoP56726 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SmoP56726 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SmoP56726 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SmoP56726 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SmoP56726 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SmoP56726 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SmoP56726 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SmoP56726 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SmoP56726 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SmoP56726 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SmoP56726 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SmoP56726 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SmoP56726 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SmoP56726 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SmoP56726 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SmoP56726 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SmoP56726 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SmoP56726 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SmoP56726 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SmoP56726 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SmoP56726 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SmoP56726 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmoP56726 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmoP56726 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmoP56726 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SmoP56726 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SmoP56726 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms