Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c39P56656 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c39P56656 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c39P56656 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c39P56656 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp2c39P56656 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp2c39P56656 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c39P56656 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c39P56656 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c39P56656 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cyp2c39P56656 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp2c39P56656 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp2c39P56656 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms