Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp5bP56480 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp5bP56480 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp5bP56480 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp5bP56480 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp5bP56480 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms