Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irf5P56477 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Irf5P56477 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf5P56477 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irf5P56477 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irf5P56477 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irf5P56477 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf5P56477 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf5P56477 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf5P56477 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf5P56477 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf5P56477 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf5P56477 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf5P56477 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf5P56477 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf5P56477 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irf5P56477 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms